La diversidad en identidad de género es un aspecto relevante que debemos tener en cuenta en las personas con autismo. Las familias de estas personas pueden mostrarse confundidas ante la verbalización de una identidad diferente a la asignada al nacer, y pueden tener dudas respecto a cuál es la mejor forma de acompañarlas. Algunas recomendaciones para favorecer que exploren el género durante la infancia y la adolescencia son:

• Respetar la vivencia subjetiva de la diversidad sexo-genérica de la persona.
• Permitir la libre exploración del género, acorde a la etapa evolutiva de la persona, creando espacios seguros para ello.
• Conceptualizar la diversidad de género como un «espectro» de posibilidades y no como una cuestión binaria (hombre o mujer).
• Ofrecer información clara sobre las diferencias entre la identidad de género, la expresión de género y la orientación sexual; y desarrollar una actitud positiva hacia las diferentes opciones.
• Desarrollar programas de educación sexo-afectivo-genéricos adecuados y adaptados a las distintas necesidades de las personas con autismo, teniendo en cuenta su nivel de funcionamiento.
• Usar esquemas y material de apoyo visual, si es necesario, para facilitar la identificación de necesidades y la comprensión de las opciones terapéuticas y sus implicaciones.
• Respetar los tiempos para la exploración del género que cada persona necesita, en función de sus características y nivel de madurez. 
• Fomentar el acompañamiento respetuoso en las familias de la persona con autismo y aprender a convivir con la incertidumbre a lo largo del proceso de identificación de la persona.